국가연구개발성과

논문 (학술지)
내시경 초음파 조직 생검을 통해 얻어진 소량의 조직을 이용한 환자아바타 오가노이드 모델

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SCI
저자명 (주·공동저자) 김혜민;
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논문구분 국외전문학술지 학술지명 Gastrointestinal endoscopy
ISSN 0016-5107 학술지 출판일자 2024-03-04
학술지 볼륨번호 0(1) 논문페이지 85 ~ 96
학술지 임팩트팩터 6.7 기여율 50 %
DOI https://doi.org/10.1016/j.gie.2024.02.021
초록 Background and aims: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) has the worst survival rate among tumors. At the time of diagnosis, more than 80% of PDACs are considered to be surgically unresectable, and there is an unmet need for treatment options in these inoperable PDACs. This study aimed to establish a patient-derived organoid (PDO) platform from EUS-guided fine-needle biopsy (EUS-FNB) collected at diagnosis and to determine its clinical applicability for the timely treatment of unresectable PDAC. Methods: Patients with suspected PDAC were prospectively enrolled at the Samsung Medical Center from 2015 to 2019. PDAC tissues were acquired by means of EUS-FNB to establish PDAC PDOs, which were comprehensively analyzed for histology, genomic sequencing, and high-throughput screening (HTS) drug sensitivity test. Results: PDAC PDOs were established with a success rate of 83.2% (94/113). It took approximately 3 weeks from acquiring minimal EUS-FNB specimens to generating sufficient PDAC PDOs for the simultaneous HTS drug sensitivity test and genomic sequencing. The high concordance between PDAC tissues and matched PDOs was confirmed, and whole-exome sequencing revealed the increased detection of genetic alterations in PDOs compared with EUS-FNB tissues. The HTS drug sensitivity test showed clinical correlation between the ex vivo PDO response and the actual chemotherapeutic response of the study patients in the real world (13 out of 15 cases). In addition, whole-transcriptome sequencing identified candidate genes associated with nab-paclitaxel resistance, such as ITGB7, ANPEP, and ST3GAL1. Conclusions: This PDAC PDO platform allows several therapeutic drugs to be tested within a short time window and opens the possibility for timely personalized medicine as a "patient avatar model" in clinical practice.
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