논문 (학술지)
Exploring the Ligand Efficacy of Cannabinoid Receptor 1 (CB1) using Molecular Dynamics Simulations
| 등록번호 | RPMS-2019-0190765486 | SCI 구분
?
※구분 : SCI(SCIE포함), 비SCI |
SCI |
|---|---|---|---|
| 저자명 (주·공동저자) | Jung Sang Won; Cho Art E.; Yu Wookyung | ||
| 논문구분 | 국외전문학술지 | 학술지명 | SCIENTIFIC REPORTS |
| ISSN | 2045-2322 | 학술지 출판일자 | 2018-09-13 |
| 학술지 볼륨번호 | 8 | 논문페이지 | 13787 ~ - |
| 학술지 임팩트팩터 | 0.0 | 기여율 | 100 % |
| DOI | 10.1038/s41598-018-31749-z | ||
| 초록 | Cannabinoid receptor 1 (CB1) is a promising therapeutic target for a variety of disorders. Distinct efficacy profiles showed different therapeutic effects on CB1 dependent on three classes of ligands: agonists, antagonists, and inverse agonists. To discriminate the distinct efficacy profiles of the ligands, we carried out molecular dynamics (MD) simulations to identify the dynamic behaviors of inactive and active conformations of CB1 structures with the ligands. In addition, the molecular mechanics Poisson-Boltzmann surface area (MM-PBSA) method was applied to analyze the binding free energy decompositions of the CB1-ligand complexes. With these two methods, we found the possibility that the three classes of ligands can be discriminated. Our findings shed light on the understanding of different efficacy profiles of ligands by analyzing the structural behaviors of intact CB1 structures and the binding energies of ligands, thereby yielding insights that are useful for the design of new potent CB1 drugs. | ||
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