논문 (학술지)
Poly-adenine-Coupled LAMP Barcoding to Detect Apple Scar Skin Viroid
| 등록번호 | RPMS-2019-0190787587 | SCI 구분
?
※구분 : SCI(SCIE포함), 비SCI |
SCI |
|---|---|---|---|
| 저자명 (주·공동저자) | Lee Se Hee; Ahn Gna; Kim Myung-Su; Jeong Ok Chan; Lee Jong Hyun; Kwon Hyuck Gi; Kim Yang-Hoon; Ahn Ji-Young | ||
| 논문구분 | 국외전문학술지 | 학술지명 | ACS COMBINATORIAL SCIENCE |
| ISSN | 2156-8952 | 학술지 출판일자 | - |
| 학술지 볼륨번호 | 20 | 논문페이지 | 472 ~ 481 |
| 학술지 임팩트팩터 | 3.168 | 기여율 | 100 % |
| DOI | 10.1021/acscombsci.8b00022 | ||
| 초록 | Apple Scar Skin Viroid (ASSVd), a nonprotein coding, circular RNA pathogen is relatively difficult to detect by immunoassay. We report here a one-step reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) assay to improve selectivity for diagnostic use in detecting ASSVd in plants. ASSVd RT-LAMP was accelerated using loop primers and was found to be highly sensitive with a detection limit of 104 copies of cDNA-ASSVd within 30 min. Real-time LAMP and melting curve analysis could differentiate between the true-positive LAMP amplicons and false-positive nonspecific primer amplification products. The optimized RT-LAMP was then followed by the addition of nonthiolated AuNP:poly-adenine (A10)-ASSVd LAMP barcodes, showing a high authentication capacity with colorimetric changes. This type of barcoding assay is a potential alternative for rapid and multiple viroid diagnosis, providing for visible sensing in the field that can be applied to viroid-free planting. | ||
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