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과제(3건)

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연구내용

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  • 대장암 특이적 정밀진단 마커 개발을 위한 다중유전체 데이터 연계 확장 분석
    (1711130341) 2021 바이오.의료기술개발(R&D) 김영준 연세대학 과학기술정보통신부 1100000000 ( 1100000000 ) 「연구개발성과」 : 생명정보(632)

    1. 대장암 유전체 마커 검증 및 noncoding 유전체로 마커 발굴 영역확장전장 유전체 데이터 기반의 유전체 변이(SNV, SNP) 분석 시스템 구축 및 마커 탐색 유전체 구조 변이(structural variation) 분석 시스템 개발 및 대장암 특이적 변이 탐색신규 및 기존 알려진 대장암 유전체 마커의 기술적 유용성 비교분석을 통한 대장암 최적의 prognostic, predictive, diagnostic 마커 발굴 2. 후성유전체 분석 시스템 구축 및 마커 발굴DNA 메틸화 변이 분석 파이프라인 구축 및 암 특이적 변이 탐색Long noncoding RNA (LncRNA) 유전자 변이를 분석할 수 있는 분석 시스템을 구축하고 대장암 특이적 lncRNA 발현 탐색DNA 메틸화 마커, lncRNA 마커와 더불어 기능적으로 연결된 유전체 마커 발굴을 통한 마커 발굴 영역 확장3. 유전체 및 후성유전체 마커의 통합 분석과 임상 데이터를 연계 분석하여 다중 유전체 통합 분석을 통해 대장암 정밀의료 마커의 고도화를 진행통합 유전체 분석 및 단일세포 전사체 분석으로 발굴된 마커 후보군을 기반으로 딥러닝 기반 멀티마커 계산모델을 통한 분석으로 마커 고도화 진행4. LIMS 기반의 대장암 정밀의료 데이터 및 시료 관리 임상데이터 연계된 다중유전체 데이터. 단일 세포 전사체 및 조절체 시퀀싱 데이터의 관리 시스템 구축 및 운영생산 데이터는 LIMS 기반으로 구축된 클러스터 서버에 보관하며 최고 수준의 보안 형식으로 개인 정보 유출의 위험성을 최소화5. 사업화 추진을 위한 사업단 운영여러 기관의 단일된 융합연구조직 구축 및 기술개발 연계로 대용량 다중유전체 자료를 지속적으로 관리하고 첨단기술 개발활동을 지원함각 기관의 융합연구조직 활성화를 위하여 효율적인 사업단 연구 컨소시엄을 구축하며, 연구과제 수행 및 사업화를 지원하는 사무국 운영**멀티오믹스 연구를 위한 플랫폼 개발은, 외부 용역을 통해 1년 내의 기간으로 진행하는 것을 계획하고 있다.플랫폼은, 기본적으로 사용자의 계정별 오믹스 데이터의 맞춤 관리기능을 가지고 있으며, 단일 오믹스 결과와 멀티 오믹스 상호분석과 시각화 모듈이 추가된다. 이러한 분석 결과와 시각화 자료를 사용자간 공유할 수 있도록 네트워크를 구성하는 형태로 진행될 예정이다.또한 과제 3단계 목표인 마커 상용화와 개인 정밀 진단 프로그램 및 표준화에 맞추어 활용이 가능하도록 플랫폼을 구성할 계획이다.

  • 대장암 단일세포 전사체 기반 예후-치료예측 바이오마커 개발
    (1711129622) 2021 바이오.의료기술개발(R&D) 박웅양 사회복지법인삼성생명공익재단 과학기술정보통신부 1000000000 ( 1000000000 ) 「연구개발성과」 : 특허(2) , 생명정보(213)

    2단계: 다중유전체 예후-치료반응예측 바이오마커의 검증과 DNA/RNA 패널 개발다중유전체 분석대상 샘플 건 DNA, RNA 추출 및 정보 생산 확장종양 단일세포 전사체 분석을 통한 종양세포 및 종양미세환경세포의 메커니즘 연구 및 네트워크 구죽단일세포 분석과 다중오믹스 데이터의 비교 및 통합분석단일세포 전사체 분석데이터와 치료반응 그룹의 상관 분석을 통한 단일세포 수준 치료반응예측 종양이질성 바이오마커 발굴 및 다중유전체 바이오마커에 대한 단일세포 수준 전사체 네트워크 분석과 검증: 검증된 후보 패널 선정 패널 제작과 패널 분석 파이프라인 개발패널성능 평가지표 설정: sequencing depth, quality score3단계: 대장암의 예후-치료반응예측 패널의 임상 유효성 검증패널 성능평가: 민감도, 특이도 평가임상-패널 데이터 통합 분석

  • 대장암 단일세포 전사체 기반 예후-치료예측 바이오마커 개발
    (1711156086) 2022 바이오의료기술개발 박웅양 삼성서울병원 과학기술정보통신부 1000000000 ( 1000000000 ) 「연구개발성과」 : 특허(2) , 생명정보(293) , 기술요약정보(1)

    2단계: 다중유전체 예후-치료반응예측 바이오마커의 검증과 DNA/RNA 패널 개발다중유전체 분석대상 샘플 건 DNA, RNA 추출 및 정보 생산 확장종양 단일세포 전사체 분석을 통한 종양세포 및 종양미세환경세포의 메커니즘 연구 및 네트워크 구죽단일세포 분석과 다중오믹스 데이터의 비교 및 통합분석단일세포 전사체 분석데이터와 치료반응 그룹의 상관 분석을 통한 단일세포 수준 치료반응예측 종양이질성 바이오마커 발굴 및 다중유전체 바이오마커에 대한 단일세포 수준 전사체 네트워크 분석과 검증: 검증된 후보 패널 선정 패널 제작과 패널 분석 파이프라인 개발패널성능 평가지표 설정: sequencing depth, quality score3단계: 대장암의 예후-치료반응예측 패널의 임상 유효성 검증패널 성능평가: 민감도, 특이도 평가임상-패널 데이터 통합 분석

국가연구개발기관(1건)

기관명

기업유형 / 지역명 / 업종명

특허(4건)

특허명

연도 / 지재권구분 / 출원등록구분 / 출원인 / 발명자 / 출원번호

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기술요약정보(1건)

기술명

연도 / 기술이전 담당자명

기술내용

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생명정보(1,138건)

생명정보명

연도 / 등록자명 / 등록기관명 / 등록필증 번호 / 등록필증부여일

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