1) 단백체-to-유전체 맵핑 원천 요소기술 개발과 최첨단 맵핑 프레임워크 구축.- 조직 프로테옴 정량 프로파일링(단백체 서열, 단백체 정량, 수식화, 접합변이, 서열변이 정보 수집)을 통해 조직시료별 광범위 단백체-to-유전체 라이브러리 구축: TCGA의 NGS데이터가 확보된 연간 50례 이상의 동일위암조직 시료를 NGS 데이터 기반의 personalized 유전체로 맵핑. 서열화 mRNA 대비 50% 이상 단백체 동정. 인산화펩티드 1000종 이상, 당쇄화 펩티드 500종 이상 동정. 정상대조군 대비 발현차 단백체 탐색 및 mRNA 발현 데이터와의 상관분석. 수식화 정보의 생체 pathway 맵핑. 맵핑된 인산화 pathway와 당쇄화 pathway 결합으로 통합적 위암 메커니즘을 개인별 유전체 변화와 연관하여 구축.- 고도 단백체-to-유전체 맵핑을 위한 최첨단 프로파일링 요소기술 개발 및 플렛폼 구축: 초고압, 다기능, 다차원 LC기술인 All-In-One LC 시스템에 의한 고감도, 고분해능 online 2DLC 분리기술, high pH RP기반의 고재현성 단백체 분획 신기술, 초고성능 분리컬럼 (> 80-cm) 적용 기술, 고감도, 고효율 질량측정을 위한 Q-Exactive Orbitrap hybrid MS 최적화 및 고분해능 데이터 활용기술, online/offline 수식화 농축 분석 병행적용 및 연계 신기술.- 악성/염증 복수 유래 프로테옴에 대한 고감도 AIMS 분석을 통한 위암 특이적 악성 복수 생분자 시그너처 스크리닝: 체액으로 분비된 시그너처 후보를 아토몰 (10-18몰) 수준에서 타겟팅할 수 있는 고감도 타겟지향적 스크리닝 기술 확립2) 위암 특이적 생분자 시그너처 후보군들의 선별과 서열화를 위한 포괄적인 프로테오지노믹 데이터 분석기준 확립 및 적용.- 위암 특이적 유전자 변이, 비정규 유전자접합, RNA-DNA 변화 등의 유전정보를 포함한 위암 특이적 단백체 탐색 기술 개발 및 유전자 변이 단백체 발굴.- 동정된 단백체 및 수식화 데이터를 차세대 유전체 데이터의 수정 및 검증, 신규 단백질 발현 유전자 탐색에 활용하는 방법론 구축. predicted exons과 유전자 validation. 질환 특이적 신규 유전자 탐색. 단백체와 유전체의 multi-level 데이터 통합·분석을 통한 생분자 시그너처 후보군 선별 및 Prioritization.
