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  • 세포 특이적 후성유전체마커 발굴 및 검증
    (1711048584) 2017 포스트게놈신산업육성을위한다부처유전체사업(미래부) 김영준 연세대학교 과학기술정보통신부 533000000 ( 533000000 ) 「연구개발성과」 : 논문(4) , 특허(6) , 연구보고서(2)

    1. 인간 유도만능줄기세포 (iPSC)의 신경분화 관련 lncRNA 탐색iPSC 미분화 및 신경분화 단계별 lncRNA 발현 profile 분석특정 lncRNA 손실 줄기세포의 전사체 및 후성유전체 데이터 생산2. 인간 유도만능줄기세포의 신경분화 관련 lncRNA 기전 규명 lncRNA을 knockdown한 iPSC 라인의 신경분화 능력 검증lncRNA가 손실된 iPSC의 전사체 및 후성유전체 변이 분석신경 분화 조절 기능을 가지는 lncRNA의 작용 기전 규명뇌신경질환 유래 iPSC의 lncRNA 비교분석을 통한 질환 특이적 lncRNA 발굴3. lncRNA의 기능 분석을 위한 생물정보 시스템 개발 lncRNA 발굴 알고리즘 및 파이프라인 개발신경세포 분화에 특이적인 lncRNA 탐색 알고리즘 개발lncRNA의 타겟 규명을 위한 전사 조절 네트워크 분석기술 개발 고급 데이터마이닝을 통한 lncRNA 기능 분석 방법 개발 4. lncRNA를 이용한 유전자 치료용 줄기세포 개발치료용 lncRNA를 이용하여 전환된 iPSC와 신경 분화 세포 개발5. 호발암 특이적 DNA methylation 변이 분석 지역 설정 TCGA에 있는 400 여명의 호발암 환자로부터 얻은 암 조직의 DNA methylation data를 분석6. Array 기반의 DNA methylation data 기본 분석7. 호발암 특이적 후성유전체 (DNA methylation) 마커 탐색DMR에 의해 영향을 받는 유전자들의 network를 분석하고 임상 데이터와 DMR 데이터를 연계 분석해 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 및 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함8. 호발암에 대한 유전체 분석호발암에서 확인한 모든 유전자 돌연변이의 분석을 통해 호발암 특이적으로 문제가 발생하는 pathway를 찾아내고, network 분석 및 임상 데이터 연계 분석을 통해 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함.9. 호발암 유전체와 후성유전체 연계 분석한 사람의 암 환자에서 얻어 낸 유전체 변이 데이터와 후성 유전체 변이 데이터를 함께 사용하여 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 및 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함10. 포스트게놈다부처유전체관련 사업에 대해 미래부와 재단의 총괄 업무 기능 담당

  • 세포 특이적 후성유전체마커 발굴 및 검증
    (1711041874) 2016 포스트게놈신산업육성을위한다부처유전체(미래부) 김영준 연세대학교 미래창조과학부 700000000 ( 700000000 ) 「연구개발성과」 : 논문(7) , 특허(2) , 생명정보(494)

    1. 인간 유도만능줄기세포 (iPSC)의 신경분화 관련 lncRNA 탐색iPSC 미분화 및 신경분화 단계별 lncRNA 발현 profile 분석특정 lncRNA 손실 줄기세포의 전사체 및 후성유전체 데이터 생산2. 인간 유도만능줄기세포의 신경분화 관련 lncRNA 기전 규명 lncRNA을 knockdown한 iPSC 라인의 신경분화 능력 검증lncRNA가 손실된 iPSC의 전사체 및 후성유전체 변이 분석신경 분화 조절 기능을 가지는 lncRNA의 작용 기전 규명뇌신경질환 유래 iPSC의 lncRNA 비교분석을 통한 질환 특이적 lncRNA 발굴3. lncRNA의 기능 분석을 위한 생물정보 시스템 개발 lncRNA 발굴 알고리즘 및 파이프라인 개발신경세포 분화에 특이적인 lncRNA 탐색 알고리즘 개발lncRNA의 타겟 규명을 위한 전사 조절 네트워크 분석기술 개발 고급 데이터마이닝을 통한 lncRNA 기능 분석 방법 개발 4. lncRNA를 이용한 유전자 치료용 줄기세포 개발치료용 lncRNA를 이용하여 전환된 iPSC와 신경 분화 세포 개발5. 호발암 특이적 DNA methylation 변이 분석 지역 설정 TCGA에 있는 400 여명의 호발암 환자로부터 얻은 암 조직의 DNA methylation data를 분석6. Array 기반의 DNA methylation data 기본 분석7. 호발암 특이적 후성유전체 (DNA methylation) 마커 탐색DMR에 의해 영향을 받는 유전자들의 network를 분석하고 임상 데이터와 DMR 데이터를 연계 분석해 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 및 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함8. 호발암에 대한 유전체 분석호발암에서 확인한 모든 유전자 돌연변이의 분석을 통해 호발암 특이적으로 문제가 발생하는 pathway를 찾아내고, network 분석 및 임상 데이터 연계 분석을 통해 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함.9. 호발암 유전체와 후성유전체 연계 분석한 사람의 암 환자에서 얻어 낸 유전체 변이 데이터와 후성 유전체 변이 데이터를 함께 사용하여 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 및 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함10. 포스트게놈다부처유전체 사업에 대해 미래부와 재단의 총괄 업무 기능 담당

  • 세포 특이적 후성유전체마커 발굴 및 검증
    (1711064775) 2018 포스트게놈신산업육성을위한다부처유전체사업(R&D)(과기정통부) 김영준 연세대학교 과학기술정보통신부 700000000 ( 700000000 ) 「연구개발성과」 : 논문(2) , 특허(6) , 생명정보(138)

    1. 인간 유도만능줄기세포 (iPSC)의 신경분화 관련 lncRNA 탐색iPSC 미분화 및 신경분화 단계별 lncRNA 발현 profile 분석특정 lncRNA 손실 줄기세포의 전사체 및 후성유전체 데이터 생산2. 인간 유도만능줄기세포의 신경분화 관련 lncRNA 기전 규명 lncRNA을 knockdown한 iPSC 라인의 신경분화 능력 검증lncRNA가 손실된 iPSC의 전사체 및 후성유전체 변이 분석신경 분화 조절 기능을 가지는 lncRNA의 작용 기전 규명lncRNA가 손실된 iPSC의 전사체 비교분석을 통한 질환 특이적 lncRNA 발굴3. lncRNA의 기능 분석을 위한 생물정보 시스템 개발 lncRNA 발굴 알고리즘 및 파이프라인 개발신경세포 분화에 특이적인 lncRNA 탐색 알고리즘 개발lncRNA의 타겟 규명을 위한 전사 조절 네트워크 분석기술 개발 고급 데이터마이닝을 통한 lncRNA 기능 분석 방법 개발 4. lncRNA를 이용한 유전자 치료용 줄기세포 분화 기술 개발치료용 lncRNA를 이용하여 전환된 iPSC와 신경 분화 세포 개발5. 간암에 대한 유전체 및 후성유전체 분석을 통한 특이적 마커 탐색호발암에서 확인한 모든 유전자 돌연변이의 분석을 통해 호발암 특이적으로 문제가 발생하는 pathway를 찾아내고, network 분석 및 임상 데이터 연계 분석을 통해 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함.DMR에 의해 영향을 받는 유전자들의 network를 분석하고 임상 데이터와 DMR 데이터를 연계 분석해 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 및 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함6. 간암 유전체와 후성유전체 연계 분석 및 검증간암 환자에서 얻어 낸 유전체 변이 데이터와 후성 유전체 변이 데이터를 함께 사용하여 타겟으로 골라진 지역들에 대한 생물학적 기작 규명암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 및 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함2세부와의 연계를 통한 혈액에서의 간암 진단이 가능한 실험적 검증 및 최종 마커 선별7. 포스트게놈다부처유전체 사업에 대해 과기정통부 및 다부처 총괄 업무 기능 담당

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