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  • 미만형 위암의 후성유전체, 전사체 데이터 확보 및 바이오마커 발굴
    (1711041928) 2016 포스트게놈신산업육성을위한다부처유전체(미래부) 김용성 한국생명공학연구원 미래창조과학부 150000000 ( 150000000 ) 「연구개발성과」 : 생명정보(200)

    미만형 위암 110예 이상 및 장형 위암과 정상점막 등을 포함한 총 150예 이상의 동결조직으로부터 미세조직세포 분리를 통한 정상점막 및 암조직세포 확보 및 DNA와 RNA 정제 및 확보 동결 분리 세포의 DNA에 대해 Illumina MethylationEPIC BeadChip 기술을 활용하여 유전체의 프로모터 및 인헨서 영역으로부터 총 85만개 CpG site에 대한 후성유전체 정보 생산동결 분리 세포의 RNA에 대해 RNA-seq 기술을 활용하여 전사체 데이터 생산 데이터 생산후성유전체 및 전사체 데이터의 통합분석을 통하여 암세포에서의 DMRs 동정 및 DMR 관련 프로모터/인헨서와 연관된 유전자 중에서 음의 상관관계를 나타내는 바이오마커 원천기술 확보

  • 미만형 위암의 후성유전체, 전사체 데이터 확보 및 바이오마커 발굴
    (1711048587) 2017 포스트게놈신산업육성을위한다부처유전체사업(미래부) 김용성 한국생명공학연구원 과학기술정보통신부 150000000 ( 150000000 ) 「연구개발성과」 : 논문(1) , 연구보고서(1) , 생명정보(201)

    미만형 위암 110예 및 장형 위암과 정상점막 등을 포함한 총 150예의 동결조직으로부터 고순도의 정상점막 및 암조직세포 확보 및 DNA와 RNA 확보 동결 분리 세포의 DNA에 대해 Illumina MethylationEPIC BeadChip 기술을 활용하여 유전체의 프로모터 및 인헨서 영역으로부터 총 85만개 CpG site에 대한 후성유전체 정보 생산동결 분리 세포의 RNA에 대해 RNA-seq 기술을 활용하여 전사체 데이터 생산 후성유전체 및 전사체 데이터의 통합분석을 통하여 암세포에서의 DMRs 동정 및 DMR 관련 프로모터/인헨서와 연관된 유전자 중에서 음의 상관관계를 나타내는 바이오마커 확보

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